刷式自清洗过滤器压差控制是最常用的核心控制方式，依靠压差传感器实时监测过滤器进出口之间的压力差值。随着过滤持续进行，滤网表面不断堆积泥沙、铁锈等固体杂质，滤网流通阻力上升，进出口压差随之增大。当监测压差达到控制系统预先设定的阈值时，控制系统自动发出清洗指令，启动刷式自清洗过滤器的毛刷电机旋转清扫滤网，同时打开排污阀排出剥离下来的污物，待清洗排污完成后，毛刷停止转动、排污阀关闭，刷式自清洗过滤器重新进入正常过滤状态。压差控制可以根据滤网实际堵塞情况启动清洗，按需触发，避免无效清洗，适合水质杂质含量波动较大的工况。
刷式自清洗过滤器定时控制属于固定周期运行的控制方式，在电控系统内部预先设置清洗时间间隔、单次清洗时长。无论滤网堵塞程度如何，到达预设时间后，控制系统自动启动刷式自清洗过滤器执行清洗流程，毛刷旋转清扫滤网，同步开启排污阀排污，计时结束自动停止清洗，设备恢复过滤。定时控制逻辑简单可靠，适合水质相对稳定、杂质含量变化小的工况，能够定期清理滤网，防止杂质长期累积板结。在实际项目应用中，定时控制一般不作为单独控制手段，多和压差控制搭配使用，作为压差控制的后备保护。
刷式自清洗过滤器压差 + 定时双模式联合控制，是现场选用最多的组合控制方式，融合两种单模式的优势。刷式自清洗过滤器运行过程中，系统持续监测压差信号，一旦压差超标就优先启动清洗程序；如果在设定的时间周期内压差始终没有达到触发值，到达预设时间，系统也会强制启动一次清洗。这种控制模式既可以实现按需清洗，又能避免压差传感器失灵、水质长期偏干净导致滤网长期不清洗、污物板结的问题，大幅提升刷式自清洗过滤器运行可靠性，绝大多数工业连续运行水系统都会选用这种双控制模式。
刷式自清洗过滤器还配备手动控制模式，主要用于设备调试、检修以及应急操作场景。在手动模式下，运维人员可以通过电控箱上的操作按钮，独立控制刷式自清洗过滤器毛刷启停、排污阀开启与关闭，不受压差和定时参数限制。设备完成安装预处理、检修完成后，可利用手动模式测试毛刷旋转、排污阀动作是否顺畅，排查机构卡滞、阀门失灵等故障；当自动控制系统临时异常时，也可短时采用手动模式控制刷式自清洗过滤器完成滤网清洗。除此之外，部分型号的刷式自清洗过滤器支持远程信号输出，可将运行状态、压差数据、故障信号上传至中控系统，实现远程监测与联动控制，方便整套水处理工艺集中管控。
